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DCM的全基因組關聯(lián)分析揭示了3p25.1和22q11.23染色體上與收縮性心力衰竭相關的兩個新參與者
發(fā)布時間:2021-09-08 19:00:00來源:

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背景介紹:擴張型心肌病(DCM)是一種在無冠狀動脈疾病或負荷異常情況下,以左心室擴張和收縮功能障礙為特征的心肌病。已報道有50多個基因與DCM相關,該病主要為常染色體顯性遺傳,且外顯率不全。


近日,在《European Heart Journal》上刊登了一篇名為“Genome wide association analysis in dilated cardiomyopathy reveals two new key players in systolic heart failure on chromosome 3p25.1 and 22q11.23”的文章,有助于更好地理解DCM的遺傳結構,并揭示心臟衰竭新的生物學途徑。


研究方法


在擴張型心肌病中進行了迄今為止最大的全基因組關聯(lián)研究,在發(fā)現(xiàn)隊列中有2719名受累個體和4440名健康對照,復制隊列中有584例受累個體和963例健康對照。全文摘要概述可參考圖1;


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圖1 圖文摘要。第一步:通過迄今為止對擴張型心肌病進行的最大的全基因組關聯(lián)研究,在染色體3p25.1和22q11.23上鑒定并重復了兩個新的位點;第二步:結合相關位點的硅和功能分析揭漏了每個位點上的最有可能致病基因:SLC6A6(3號染色體)和SMARCB1(22號染色體)。這兩個新角色的發(fā)現(xiàn)揭示了新的生物學途徑和假定的新的治療靶點。


研究結果



確定了與擴張型心肌病相關的四個位點。其中,位于10號染色體的BAG3 rs61869036 和1號染色體的HSPB7 rs10927886是已知的。鑒定和重復了兩個新的相關位點:位于3p25.1號染色體[單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點rs62232870,分別在發(fā)現(xiàn)和重復隊列中P=8.7×10-11和7.7×10-4]和22q11.23號染色體[(SNP 位點 rs7284877,分別在發(fā)現(xiàn)和重復隊列中P=3.3×10-8和1.4×10-3)]。



根據(jù)這四個擴張型心肌病基因座的風險等位基因數(shù)構建的遺傳風險評分顯示,與具有5個風險等位基因的個體相比,具有8個風險等位基因的個體患擴張型心肌病的風險增加了27%,具有1種風險等位基因的個體換擴張型心肌病的風險降低了21%。


iPSC衍生心肌細胞的硅注釋和功能4C測序分析表明,在3p25.1染色體上SLC6A6基因最可能導致DCM。該基因編碼牛磺酸轉運體,其參與心肌功能障礙和DCM,并在人類和動物身上的大量觀察結果支持了這一觀點。


在22q11.23位點,在硅片和數(shù)據(jù)挖掘注釋中,以及在較小程度上的功能分析,強烈建議SMARCB1基因作為候選致病基因。


小結:迄今為止對DCM進行的最大的全基因組關聯(lián)研究揭示了3p25.1和22q11.23染色體上兩個新的DCM相關位點(在兩個位點中最有可能的致病候選基因分別是SLC6A6SMARCB1),并構建一個多基因風險評分來更好地預測DCM的風險。這項研究為DCM的遺傳結構提供了更好的理解,鑒定了與收縮性心力衰竭病理生理學的新參與者,具有新的治療發(fā)展?jié)摿Α?/p>



更多心肌病相關信息,詳見:


《JACC新發(fā)現(xiàn)——心臟基因型可以增加心肌炎風險》

《15兒童期與成人期肥厚型心肌病的臨床特點及預后差異》

《非缺血性擴張型心肌  病心力衰竭患者的新型治療:自體干細胞貼片植入的臨床有效性觀察》

《Circulation:擴張型心肌病相關基因的循證評估》



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