患者在接受基因檢測(cè)后，對(duì)于潛在的孟德?tīng)栠z傳病，其診斷率受到多種因素的影響，主要原因如下：

1）許多孟德?tīng)栠z傳病的遺傳基礎(chǔ)仍然未知；

2）在已知潛在基因的疾病情況下，所進(jìn)行的檢測(cè)可能存在無(wú)法覆蓋相關(guān)基因（如單基因或多基因檢測(cè)panel）、變異類型（如短串聯(lián)重復(fù)）或表觀遺傳標(biāo)志（如甲基化狀態(tài)）的情況；

3）技術(shù)限制可能會(huì)導(dǎo)致難以在外顯子組測(cè)序（ES）中識(shí)別致病性變異，尤其是在檢測(cè)拷貝數(shù)變異（CNVs）方面；

4）可能沒(méi)有足夠的證據(jù)來(lái)解釋變異的致病性；

5）診斷率一直取決于在變異鑒定時(shí)可用的表型信息的詳細(xì)程度。

目前在懷疑患有遺傳性疾病的個(gè)體中進(jìn)行精確分子診斷的方法主要包括傳統(tǒng)檢測(cè)方法（如外顯子組測(cè)序（ES）、拷貝數(shù)變異（CNVs）檢測(cè)，表型已知的基因panel檢測(cè)等）和新興技術(shù)檢測(cè)方法（如RNA sequencing (RNA-seq)、optical genome mapping (OGM)、long-read GS (lrGS)等），但不同類型的基因檢測(cè)技術(shù)存在一定優(yōu)勢(shì)和局限性（表1）。

ES對(duì)不同表型和孟德?tīng)栠z傳病的診斷成功率在25%到40%之間，在近親結(jié)婚較為普遍的人群中，診斷率更高，也就是說(shuō)更容易通過(guò)ES找到潛在的遺傳問(wèn)題。雖然總體上來(lái)看，通過(guò)ES獲得的診斷率相對(duì)較高，但在進(jìn)行了ES之后，仍然有超過(guò)50%的被檢測(cè)個(gè)體沒(méi)有被明確診斷出患有具體的疾病。對(duì)于懷疑患有遺傳性疾病的個(gè)體來(lái)說(shuō)，其ES檢測(cè)結(jié)果為陰性，這可能與ES檢測(cè)方法的局限性有關(guān)，需要注意相關(guān)事項(xiàng)并采取相應(yīng)的后續(xù)策略（表2、圖1）.

對(duì)ES數(shù)據(jù)重新分析可能也會(huì)找出導(dǎo)致某種疾病的變異（圖1）。這是因?yàn)檫@些變異出現(xiàn)在基因覆蓋范圍較低的區(qū)域或出現(xiàn)在未測(cè)序的受影響組織中。比如一些已知的致病變異位于基因的非編碼區(qū)域，例如內(nèi)含子或啟動(dòng)子區(qū)域，這些區(qū)域在標(biāo)準(zhǔn)的ES中可能被漏檢。但如果專門設(shè)計(jì)了一個(gè)基因測(cè)序panel，用來(lái)捕獲包含這些變異區(qū)域的信息，那么就可以更容易地檢測(cè)到這些變異。

圖1 外顯子組測(cè)序結(jié)果為陰性時(shí)的下一步選擇

Wojcik MH, Reuter CM, Marwaha S, et.al. Beyond the exome: What's next in diagnostic testing for Mendelian conditions. Am J Hum Genet. 2023 Aug 3;110(8):1229-1248.